1- مرکز تحقیقات کاربردی دارویی، دانشگاه علوم پزشکی تبریز، تبریز، ایران ، kafilhs@tbzmed.ac.ir 2- مرکز تحقیقات بیماری های عفونی وگرمسیری، دانشگاه علوم پزشکی تبریز، تبریز، ایران 3- مرکز تحقیقات بیوتکنولوژی، دانشگاه علوم پزشکی تبریز، تبریز، ایران 4- گروه باستان شناسی، دانشکده علوم انسانی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران
چکیده: (9419 مشاهده)
زمینه و هدف: واکنش زنجیره ای پلیمراز (PCR) یکی از مهمترین ابزارهای تشخیصی ملکولی مدرن میباشد که ما را قادر میسازد تا به بررسی ابعاد مختلف ملکولی یک یاخته بپردازیم. از اصلیترین اجزاء آزمون واکنش زنجیره ای پلیمراز، DNA میباشد که با استفاده از آن و تکثیر بخشهای اختصاصی آن قادر خواهیم بود تا ابعاد مختلف حیاتی یک یاخته را مورد بررسی قرار دهیم. در این مطالعه ما با استفاده از بررسی گروهی از نمونههای باستانی متعلق به 3600 سال پیش شامل نمونههای استخوان و دندان باستانی کشف شده در منطقه بهشهر استان مازنداران، به بررسی و بهینه سازی روش استخراج DNA پرداختیم تا بتوانیم با کسب حداکثر ژنوم استخراج شده سالم به بررسی های بالینی و ژنومی بر روی آن ها بپردازیم.
روش بررسی: در این مطالعه با استفاده از پروتکل تخلیصی قبل از استخراج و حذف مهارکنندههای واکنش زنجیره ای پلیمرازو سپس استخراج با استفاده از ذرات سیلیکا بید به بررسی نتایج استفاده از این روش بهینه شده پرداختیم.
یافتهها: نتایج استخراج DNA در نمونه های مورد مطالعه در مطالعه حاضر به ترتیب 37ng/µl ، 25ng/µl، 7ng/µl ، 32ng/µl ، 18ng/µl ، 42ng/µl بودند که در 67% موارد دارای خلوص عالی و میزان جذب نوری 8/1 بودند. همچنین ژنوم استخراج شده در این مطالعه جهت بررسی های ژنومیک واکنش زنجیره ای پلیمراز مورد استفاده قرار گرفتند که در تمامی نمونه ها نتایج قابل قبولی را ارائه نمودند.
نتیجهگیری: نتایج حاصل نشان از استخراج مناسب و خالص و قابلیت استفاده از این ژنوم در مطالعات ژنومی می داد. لذا این روش برای استخراج از انواع نمونه های استخوانی، دندانی و غیره که بافت قابل استخراج به سادگی در دسترس نمی باشد توصیه می گردد.
Samadi Kafil H, Asghar zadeh M, Zeinal zadeh E, Hossini Sarteshnizi S B. Optimizing Bone DNA Extraction for Obtaining High Yield Genome of Ancient Teeth and Bones . Iran J Forensic Med 2014; 20 (2) :7-13 URL: http://sjfm.ir/article-1-589-fa.html
صمدی کفیل حسین، اصغرزاده محمد، زینال زاده الهام، حسینی سرتشنیزی سید بها. بهینه سازی روش استخراج DNAاز استخوان برای به دست آوردن ماده ژنتیکی از استخوان و دندان های باستانی . مجله پزشکی قانونی ایران. 1393; 20 (2) :7-13